2010年9月，北京清华医院一期工程综合楼、门急诊及病房楼、行政及动力中心楼先后全面开工。

    医院综合楼建筑面积近3万平方米，地上11层、地下2层，主要为体检中心、教学科研用房及医护宿舍；门急诊及病房楼建筑面积10余万平方米，地上13层，地下2层；行政及动力中心楼建筑面积近8千平方米，地上四层。医院的总体设计方案秉承台湾长庚纪念医院管理模式，采用集中式、经济型的建筑风格，通过人性化的空间布局和高效率的动线设置，以及生态环境的营造和节能措施的普遍运用，彰显“以人为本”和“绿色环保”的理念。

    清华大学副校长张凤昌，清华大学医学院常务副院长施一公教授、学术委员会主任孙芳霖教授，台湾长庚援建团队负责人，北京清华医院负责人及清华大学基建处、施工方等单位代表出席了开工仪式。张凤昌副校长听取了台湾长庚援建团队负责人所做的施工进度及未来医院运营规划的简要汇报并发表讲话。施一公教授、清华大学基建处副处长邢毅分别发表了讲话，对医院的全面开工表示祝贺。

    根据施工计划，综合楼预计于2011年年底竣工并投入使用，门急诊及病房楼、行政及动力中心楼预计于2013年底竣工并投入使用。